/ admin abre a 'Sessão do Console', isto é, abre a sessão local em oposição a uma sessão RDP. Se o seu aplicativo Java for iniciado com a mesma conta, você poderá fechar os processos associados para você, aplicativo Java também.
Tente criar uma conta de administrador diferente especificamente para iniciar seu serviço. Lembre-se de especificar a nova conta na inicialização do seu serviço.