Tente o caminho completo para o arquivo:
mysqlimport -u wendel2go -p --fields-terminated-by='\t' b2g /home/username/Desktop/gene2accession
Substitua "username" pelo seu nome de usuário.
Estou montando um banco de dados local para anotação genética seguindo as instruções em esta página . Eles fornecem um arquivo .sql para criar algumas estruturas de tabelas do MySQL (etapa 4) e vários arquivos de dados para preencher as tabelas (etapas 5-7). Eu completei o processo de configuração até a etapa 5, mas estou recebendo erros na etapa 6. O que me irrita é que o erro que estou recebendo é diferente com base em qual diretório eu executar o comando mysqlimport .
standage@farnsworth:~$ mysqlimport -u wendel2go -p --fields-terminated-by='\t' b2g Desktop/gene2accession
Enter password:
mysqlimport: Error: 13, Can't get stat of '/var/lib/mysql/Desktop/gene2accession' (Errcode: 2), when using table: gene2accession
standage@farnsworth:~$ cd Desktop/
standage@farnsworth:~/Desktop$ mysqlimport -u wendel2go -p --fields-terminated-by='\t' b2g gene2accession
Enter password:
mysqlimport: Error: 29, File '/var/lib/mysql/b2g/gene2accession' not found (Errcode: 2), when using table: gene2accession
Não estou obtendo resultados muito informativos quando estou pesquisando esse erro. Alguma idéia?
Atualização : ainda recebo um erro quando uso o caminho completo do arquivo, mas o arquivo não encontrado é diferente agora.
standage@farnsworth:~$ mysqlimport -u root -p --fields-terminated-by='\t' b2g /home/standage/Desktop/gene2accession
Enter password:
mysqlimport: Error: 29, File '/home/standage/Desktop/gene2accession' not found (Errcode: 13), when using table: gene2accession
standage@farnsworth:~$ list /home/standage/Desktop/gene2accession
-rw-r--r-- 1 standage standage 1.6G 2010-12-01 14:31 /home/standage/Desktop/gene2accession
O arquivo existe e não é um problema de permissões.