Você está enfrentando sérios problemas de contenção de E / S de disco quando seu processo de BI está fazendo todas essas extrações. Considerando como ele funciona (dados de consulta em prod para mover para o warehouse) não há muito que você possa fazer em termos de armazenamento com sua configuração para melhorar as coisas. Você simplesmente precisa de mais fusos. Fazendo algum PerfMon é executado para ver se seus problemas são devido ao banco de dados de BI cometer dados (gravações) ou todas essas consultas consumindo operações de entrada e saída. Se mais tarde, coloque mais fusos nesse banco de dados, sempre que possível, para ajudar a suavizar as coisas.
Você pode querer investigar seriamente o aumento da quantidade de RAM que tem em seu servidor de banco de dados, pois isso ajudará a reduzir parte da pressão do disco que você está vendo.