Eu usei muitos deles ("vanilla" rsync, rsnapshot, rdiff-backup e duplicidade) e achei a duplicidade superior a todo o resto. Sua capacidade de lidar com backups incrementais e criptografados não é encontrada em nenhum outro lugar nessa classe de aplicativos de backup. Além disso, é bastante flexível quanto ao armazenamento de back-end que ele usa. Eu uso o Amazon S3 com duplicidade, mas todos podem usar scp, ftp, dav, etc.