A menos que a carga sobre os bancos de dados seja muito uniforme, você provavelmente verá um melhor desempenho se usar vários arquivos em um grupo de arquivos e um único banco de dados em vários bancos de dados espalhados em vários discos. Isso é devido ao código de distribuição de carga em ms sql, que normalmente é muito melhor do que tentar escolher discos manualmente para cada banco de dados.
Uma breve introdução pode ser encontrada no link , mas há um muito mais do que isso.
Você também deve dar uma olhada em SQL Server 2005/2008 - vários arquivos / grupos de arquivos - quantos? Por quê? , que tem uma boa discussão sobre o uso de vários grupos de arquivos.
Ah, ter todos os seus arquivos de log no mesmo disco provavelmente lhe dará um afunilamento de E / S, a menos que esse disco seja muito rápido e a carga de gravação seja baixa. Tenha cuidado lá.
No final, verifique suas filas de IO. Se você não ficar preso esperando por IO, não faz sentido se preocupar com o desempenho do seu disco. A mudança pode ser possível motivar simplesmente porque o design do banco de dados é muito mais limpo.