No Fedora, acredito que esteja em /etc/sysconfig/httpd e você mude o umask lá - umask xxx .
Eu preciso definir o umask padrão no apache no fedora para que meus arquivos carregados tenham permissões 644 que são definidas como 600 por padrão, apesar de fazer chmod ($ uploaded_file, 0644); no script php. Alguém pode fornecer alguma direção ...?