A Symantec não oferece suporte ao SQL Server 2008 com o Backup Exec 12 Remote Agent. Tanto quanto sei, BackupExec exigirá sua própria instância do SQL 2005 como seu backing store, você pode usar a versão gratuita que vem com o BackupExec para instalar e executar o BackupExec 12 e SQL 2008 na mesma caixa. Você teria que manter tanto o SQL 2005 quanto o SQL 2008 com relação a atualizações.
A atualização para 12,5 só é gratuita se você tiver um contrato de manutenção (que custa cerca de 10% do preço inicial de compra por ano). No entanto, uma atualização é avaialble se você não tiver manutenção, lembre-se que você terá que atualizar o servidor de mídia e os agentes remotos se você estiver fazendo backup de / para mais de um servidor.