A primeira solução que me vem à mente é criar aliases para todos os usuários, para que ln = ln -s.
Você pode fazer isso criando um script em /etc/profile.d:
sudo vim /etc/profile.d/aliases.sh
Em seguida, insira seu alias:
alias ln='ln -s'
Feche e reabra seus terminais ou execute exec bash
(presume que você esteja usando o bash)
Isso deve impedir que qualquer um execute hardlinks em vez de simbólicos.