Seu alto uso é do mysql. Você tem algumas consultas que consomem muitos recursos, o php-cgi é deixado esperando que as consultas do banco de dados terminem e o httpd fica esperando que o php-cgi retorne. Se você determinar quais consultas são responsáveis por esse consumo, poderá otimizar essas consultas.
E sua carga não é tão alta. Você tem 4 processadores, qualquer carga próxima a 4 não é alta. Uma carga máxima de 5,4 é aceitável.