Se você não se preocupa com a perda parcial de dados e não deseja redundância, sugiro que você crie um sistema de arquivos separado em cada disco físico e divida-o como programa. Eu acho que você está usando para dados com hash ou algo assim - nesse caso, muitas vezes é possível dividir dados em diretórios - por exemplo - com base na soma md5 de arquivos - e dividir os dados em discos diferentes em parte. Mouting it - não é problema - você pode ter chave compartilhada para dispositivos de bloqueio de decodificação colocados em armazenamento não criptografado.
Se você quer redundância - simplesmente use o raid5 ou algo parecido. Ou - mais "software" de armazenamento - gluster ou ceph.
Os sistemas de arquivos padrão não estão preparados para situações em que parte do espaço onde estão desaparecerá.