Sim, você pode excluí-los. A questão é melhor descrita aqui:
Você provavelmente deseja fazer um backup dos dados da zona DNS primeiro:
DNSCMD.exe dcName /ZoneExport zonename zonename.txt
Por exemplo:
DNSCMD.exe CONTOSODC1 /ZoneExport contoso.com contoso.com.txt
DNSCMD.exe CONTOSODC1 /ZoneExport _msdcs.contoso.com _msdcs.contoso.com.txt
Isso criará os arquivos txt de backup em% systemroot% \ system32 \ dns \