Eu encontrei o problema como você. Felizmente para mim apenas três funcionários usam a caixa freenas para salvar drivers, isos e coisas assim e não causaram nenhuma grande dor de cabeça. Aqui está como eu cheguei nessa situação. Eu instalei a atualização mais recente do Freenas 9.3. O número de atualização é FreeNAS-9.3-STABLE-201501090144 no log de atualização que mostra que corrige um problema do Active Directory. Infelizmente, a atualização não corrigiu meus problemas, mas eu tentava fazer o upgrade antes de fazer o próximo passo. Para fazer o Freenas 9.3 funcionar no Active Directory, tive que fazer uma Factory Restore e re-configurar todas as minhas configurações novamente. Eu também deletei a caixa freenas fora do domínio e dns. Este não foi um grande problema para mim, porque eu só tinha três ações apenas uma dor na bunda. Depois que eu tiver tudo configurado novamente no Active Directory, eu poderia ir para o shell e fazer o grupo wbinfo -u, wbinfo-g, getent passwd e getent e ver os grupos e usuários do Active Directory a partir do shell. Espero que isso ajude.