Primeiro, você deseja listar os SPNs para identificar o SPN duplicado:
setspn -L <server>
Em seguida, remova o SPN duplicado:
setspn -d service/name hostname
Serviço / nome é o SPN que deve ser removido e hostname é o nome real do host do computador.
Por segurança, anote o SPN que você está excluindo, caso você o exclua. Na chance de que você exclua o errado, você pode adicioná-lo novamente:
setspn –A service/name hostname