Se você tentar clonar em mdadm , estará apenas procurando por problemas se alguma vez misturar os pares clonados. Em outras palavras, se uma dessas máquinas tiver um problema e você conectar a unidade na outra para tentar recuperar os dados dela, mdadm ficará muito confuso ao ver três unidades que parecem fazer parte das mesmas duas matriz de drives.
Melhor para criar uma nova matriz em cada máquina e, em seguida, rsync ou, se for necessário, partclone do seu sistema de arquivos. Também com o grub2 você pode pular a partição / boot e instalá-la em ambos os MBRs diretamente.