Pergunta interessante, mas parece possível. Pode não ser uma má idéia testar primeiro, mas você provavelmente poderia testá-lo rapidamente (e se isso estragar tudo, você pode corrigi-lo rapidamente).
You can extend PVLANs across switches with the use of trunks. Trunk ports carry traffic from regular VLANs and also from primary, isolated, and community VLANs. Cisco recommends the use of standard trunk ports if both switches that undergo trunking support PVLANs.
Eu não acho que você precise fazer nada de especial nas portas de tronco, além de adicioná-lo como uma VLAN permitida e, em seguida, configurar a vlan privada no outro switch. Você também o entraria no roteador como se fosse uma VLAN normal.