Eu acho que o devkit Java FastCGI diretamente do fastcgi.com tem alguns bugs. Ele foi modificado pela última vez no ano 2000. Verifique minha resposta aqui , a resposta tem um patch que eu precisava aplicar, por a interface FastCGI para trabalhar por mais de uma solicitação (é estranho como você nem recebe uma solicitação). Se o patch não funcionar para você no Nginx, a interface provavelmente terá mais bugs. Considere experimentar o Apache 2.4+. Você poderia usar o Wireshark para comparar a comunicação FastCGI e encontrar o outro bug, ou você poderia simplesmente usar o Apache 2.4 +.