Eu encontrei o problema. Parecia claro que o problema era com algumas das minhas personalizações no painel padrão, então executei cada uma delas, passo a passo, e descobri que a barra de tarefas pára de funcionar corretamente quando eu removo o alternador da área de trabalho do painel ( Eu não uso vários desktops). Se eu voltar a adicioná-lo, tudo funciona bem novamente.
Faz sentido, porque o alternador de área de trabalho é um dos poucos plug-ins de painel que precisam de feedback da área de trabalho, para mostrar miniaturas de janelas e seu posicionamento. Parece que quando nenhum switcher de desktop está presente em um painel, o lxpanel para de receber atualizações do windows, então o plugin da barra de tarefas (que também precisa dessas atualizações para atualizar os títulos) pára de funcionar também. Parece um bug para mim, eu preenchai .