Ambientes de virtualização, como o Hyper-V, na maioria das vezes apenas criam uma máquina virtual, que é igual a uma máquina física em relação ao software em execução. Naturalmente, todo produto de virtualização vem com um conjunto de ferramentas que permitem afetar o software em execução na VM.
Para configuração do sistema operacional convidado, no entanto, o Hyper-V não oferece nada além do que você tem para uma máquina física. Imagine inicializar uma máquina física de um servidor PXE. Você pode configurar uma imagem nesse servidor e um conjunto de arquivos autônomos para vários clientes. Então o sistema operacional que você quer é instalado na máquina física quando você o inicializa.
O mesmo é verdade aqui. Você pode preparar uma imagem para ser inicializada em uma VM. Mas isso não é diferente de preparar uma imagem para inicializar em hardware físico. O Hyper-V não tem nada a ver com isso. Apenas acontece de ser armazenado dentro de um VHD.
O SCVMM é um produto de gerenciamento que faz várias coisas, incluindo a preparação de imagens e a configuração de VMs em servidores Hyper-V. Se você não quiser usá-lo, tudo bem. Mas não olhe para o Hyper-V para oferecer serviços de configuração do sistema operacional convidado. Para isso, você precisará tratar a carga de trabalho do convidado como faria com qualquer outra máquina.
Se você quiser montar um VHD para manipular os arquivos nele sem o SCVMM, consulte esta entrada de blog para obter um exemplo de código de script: