Existem algumas opções que permitem desarmar a criptografia até o próximo ciclo de energia.
Eu tenho um pequeno sistema embarcado que suporta fat32. Ele não tem nenhuma opção de criptografia para os arquivos que ele salva em um disco externo conectado ao USB. Modificar a fonte para suportar criptografia não é uma opção. Existem unidades externas, ou algo assim, que podem ser usadas para criptografar os arquivos quando eles são colocados no disco? Algo que não requer a cooperação do sistema embarcado?
Eu percebo que isso é um pouco improvável, mas você nunca sabe!
Existem algumas opções que permitem desarmar a criptografia até o próximo ciclo de energia.
Os dispositivos USB IronKey têm criptografia no dispositivo. Uma pesquisa no Google por disco rígido criptografado produz alguns resultados úteis.