Eu escrevi no ServerFault por algum tempo de volta para mostrar que você não pode Desabilite as teclas e habilite as teclas em uma tabela InnoDB.
CHECK TABLE deve sempre tabelar qualquer tabela MyISAM ou InnoDB.
Você pode criar um script chamado /var/lib/mysql/my_init.sql com o seguinte
CHECK TABLE < seja qual for a tabela 1 & gt ;;
CHECK TABLE < qualquer tabela 2 & gt ;; ...
Este arquivo deve conter o número de tabelas que você deseja verificar em TABLE.
Agora adicione esta linha ao /etc/my.cnf
init_file = / var / lib / mysql / my_init.sql
Em seguida, reinicie o mysql e o script da tabela de verificação customizada será executado.
BTW, espero que você esteja usando innodb_file_per_table. Se você não for, leia este URL