Você precisa saber o tamanho do bloco do seu disco ou o tamanho da faixa em um ataque / LVM. Partições desalinhadas acontecem nos casos em que os blocos do sistema de arquivos não estão 'alinhados' com os blocos no disco (ou pedaços em um ambiente distribuído como armazenamentos, RAID ou LVM). Portanto, se você tiver um tamanho de bloco de 8k no armazenamento, use tamanhos de bloco de 8k no sistema de arquivos host. Além disso, a primeira partição no disco perderá 63 kb por causa do MBR, inicie sua partição (usando fdisk) no próximo limite de bloco / bloco. Exemplo: você tem um pedaço de 64k no seu array RAID / Storage, então inicie a partição no 128th kb para que você seja alinhado ao segundo pedaço do seu array. Boas informações aqui: link
EDITAR : Para verificar o alinhamento atual, faça um fdisk -l no disco que você está usando:
# fdisk -lu /dev/sda
Device Boot Start End Blocks Id System
/dev/sda1 * 63 97659134 48829536 7 HPFS/NTFS
Como você pode ver, ele está começando em 63 (logo após o MBR), então provavelmente está desalinhado com o tamanho do bloco de disco. A maioria das pessoas recomenda que você use 128, mas esse valor pode mudar dependendo do tamanho do cluster de disco.
Infelizmente, você precisa reparticionar o seu disco para consertar isso, mas talvez usando alguma ferramenta como o parted você possa alterá-lo "on the fly" ou pelo menos sem o formato.