Interpretação mais simples do erro: o IIS detectou uma pasta chamada
C:\inetpub\wwwroot\BudgetManagerMain\BudgetManager
e tentou ler um arquivo web.config desse local, mas a conta Pool de aplicativos não pôde ler um arquivo web.config nessa pasta .
Isso provavelmente ocorrerá por causa das permissões de NTFS que impedem que a conta do Serviço de Rede (que você anotou acima) acesse essa pasta.
A conta do pool de aplicativos requer acesso de leitura a todas as pastas e arquivos web.config no site.