Sim, você pode. Veja o blog de Ben Armstrong para obter informações sobre como construir seus scripts.
Minha maior pergunta é por que você acha que precisa de um disco de passagem?
Eu tenho o Windows Server 2008 R2 com Hyper-V e uma VM com um disco de passagem. Naturalmente, não consigo tirar um instantâneo (é uma limitação do Hyper-V), mas posso usar um script para o disco de desmontagem, tirar um instantâneo e depois remontar o disco?
Sim, você pode. Veja o blog de Ben Armstrong para obter informações sobre como construir seus scripts.
Minha maior pergunta é por que você acha que precisa de um disco de passagem?