Você pode usar o Clonezilla Live :
Dois tipos de Clonezilla estão disponíveis, Clonezilla live e Clonezilla SE (edição do servidor). O Clonezilla live é adequado para backup e restauração de uma única máquina
OR
Ferramenta Systemback
A ferramenta Systemback permite que você crie pontos de restauração, backups e imagens ao vivo de um sistema em execução. Atualmente, funciona apenas para derivativos do Ubuntu com base em 14.04, 14.10 e 15.04.
sudo add-apt-repository -y ppa:nemh/systemback
sudo apt-get update
sudo apt-get install systemback