A velocidade do RAID é ruim, mas não é extremamente ruim para essa configuração. Agora que você tem um backup de bateria, você deve melhorar seus parâmetros ext4, particularmente desligar as barreiras (elas são desnecessárias com uma bateria). Eventualmente você pode querer tentar outro sistema de arquivos também (o XFS é sempre o mais rápido para acesso sequencial).
edit: Quando a reconstrução estiver concluída, você pode querer ajustar algumas configurações, particularmente a leitura antecipada e a profundidade da fila:
blockdev --setra 4096 /dev/sdXX
echo 512 > /sys/block/sdXX/queue/nr_requests
Experimente valores diferentes e veja se faz alguma diferença.