Você deve usar um benchmark adequado ao uso do servidor. Se for um servidor de e-mail, você deve comparar a entrega de e-mails. Se for um servidor de arquivos, você deve comparar o io. Se você usá-lo para cálculos, você deve executar um desses.
IMHO você vai perder desempenho se o seu servidor vmware não tem mais poder ... Se você quiser se divertir, tente o bonnie ++.