Tivemos os mesmos problemas e poderíamos atribuí-lo à presença dos plugins de sonar-license e sonar-plsql. Parece que o plug-in plsql costumava ter uma licença diferente e o SonarQube não lidou com esse caso normalmente durante a atualização para o 6.7 (que viu a mudança para um modelo de licença / implementação diferente).
Verifique novamente a guia "Marketplace" nas configurações e veja se há plugins marcados como "Instalados" com uma marca de seleção ao lado deles e não há como desinstalá-los da interface do usuário da Web - se o problema for parecido com o nosso , estes são os prováveis culpados.