Em vez de excluir o usuário, você pode alterar o UID e o GID do seu usuário:
usermod -u <NEWUID> <USERNAME>
groupmod -g <NEWGID> <GROUP>
O grupo padrão tem o mesmo nome do seu nome de usuário.
Lembre-se no Ubuntu que a UId de 0 a 99 é reservada como usuário do sistema.
Também usuários com UID < 1000 não aparecerá nas listas de usuários, então escolha um UID > 1000
Agora você pode excluir o usuário com toda a segurança, se quiser.