Isso se aplica em ambas as situações. Mais especificamente, essa opção deve se aplicar em qualquer caso em que o local atual não corresponda ao local especificado na política.
Em uma nota secundária, se você nunca usou o redirecionamento de pastas, continue com cuidado. Da experiência passada, raramente funciona perfeitamente. Você se depara com problemas de permissões, usuários com pastas enormes que levam uma eternidade para copiar, etc. Examinar o número de hotfixes específicos de FR para qualquer sistema operacional da Microsoft deve dar uma boa ideia. Eu recomendaria strongmente testar qualquer política FR em um pequeno grupo de usuários, cujos perfis você fez backup primeiro, antes de implantá-la em massa. Além disso, definitivamente atente para este bug FR particularmente desagradável que pode ocorrer quando você usa a opção "mover conteúdo".