Consegui remover o compartilhamento fazendo login no DC primário, digitando unc no explorer para abrir o compartilhamento \primarydc\
e clicando com o botão direito do mouse na pasta Files
- > compartilhando e removendo o tick de compartilhamento.
O erro foi devido a um erro da minha parte, ao definir o caminho da raiz do dfs, usei D:\DFSRoot
em vez de C:\DFSRoot
e, como a unidade D: \ não existia no DC local, ele estava retornando caminho não encontrado.
O cancelamento do Compartilhamento de arquivos com falha e o uso de um caminho válido permitiram que o namespace DFS fosse configurado adequadamente sem problemas.