Isso certamente parece um código de bloqueio (ou seja, bloqueio no sentido de exclusão mútua), mas é difícil saber com certeza. Como o aviso indica, a única maneira de garantir que você está obtendo informações corretas é ter o Apache sendo executado em um depurador quando a falha ocorrer. Esse mesmo método também garantirá que você consiga extrair outras informações relevantes sobre o estado do sistema.
É claro que a solução prática pode ser simplesmente jogar alguns macacos em algumas máquinas de escrever e ver se você não pode, assim, dançar fora do problema sem ter que recorrer a algo tão doloroso quanto depuração do Apache no Windows. Por exemplo, você poderia tentar uma distribuição diferente da pilha WAMP ou alternar sistemas operacionais nos servidores (se for prático). Em última análise, isso é muito difícil de resolver, então ambas as rotas - encontrar e resolver o problema, ou fazer uma volta ao redor - merecem total consideração.
Por que vale a pena, no Linux, eu tenho a tendência de achar que esses problemas são os que mais geram caches, otimizadores e (de) ofuscadores opcache. Se você estiver executando esse código, por exemplo, IonCube, ZendGuard, APC, o Windows Cache Extension para PHP, etc. - considere desativá-lo por uma ou duas horas e veja se os problemas desaparecem.