Confira o Gerenciador de recursos de servidor de arquivos, ele tem alguns recursos de geração de relatórios que podem fornecer o que você está procurando. Na pior das hipóteses, ele pode mostrar a data da última modificação de todos os arquivos.
A maioria das ferramentas de backup, uma vez instaladas e em execução, só terá backups incrementais (ou deltas) do que foi alterado. Você pode então monitorá-los para ver quais arquivos estão normalmente mudando.