A melhor opção é criar uma imagem do disco atual. Teste para ter certeza de que funciona.
- Sua homefolder não será alterada ou: não deve ser alterada.
- Gimp: as configurações estão na sua pasta pessoal.
- Apache, PHP, MySQL, Postgres, Tomcat: as atualizações podem interromper o que você executa na sua máquina. Eu não posso dizer daqui, é uma questão de teste. Algo pode depender de uma função que não está mais disponível e será quebrada.
- Backup de pastas e arquivos em / etc onde os arquivos de configuração do Apache etc. estão localizados. Você pode fazer o backup de toda a pasta / etc, pois provavelmente não é muito grande. Você precisa ser root para fazer isso. Faça isso com o tar e certifique-se de preservar os direitos e a propriedade.
- Os trabalhos do Cron devem permanecer os mesmos, faça o backup deles se você não tiver certeza.
O programa de atualização pode perguntar o que fazer com o (s) arquivo (s) de configuração do Apache: sobrescrever, manter? Você deveria mantê-los. O mesmo para outros arquivos de configuração: mantenha-os.