Neste momento, não parece haver nenhuma maneira de replicar os volumes compartilhados do cluster usados pelo Hyper V para armazenar VMs em cluster. Se alguém puder encontrar um, eu vou marcar o deles como a resposta.
EDIT: Bumped em torno deste post e decidiu que vale a pena fazer uma edição para a resposta. É 2018 e não 2010 agora e há um monte de opções nos dias de hoje. O WS2016 + possui um recurso interno chamado Storage Spaces Direct (S2D), que vem com a edição do Datacenter e permite a replicação de CSVs (na verdade, os discos virtuais são o armazenamento de back-end dos CSVs).
Há também a Réplica de Armazenamento, que é mais uma solução de recuperação de desastre (DR), mas também pode ser colocada em uso quando há necessidade de implantar a replicação de CSV. Esse recurso também exigia a edição do Datacenter (há rumores de que a versão despojada do SR será lançada como parte do Standard com o WS2019, mas ainda não há nada na pedra).
Existem ferramentas de terceiros, como o Virtual SAN da StarWind (Free), que também podem ser usadas para replicar CSVs. Funciona com a edição Standard do Windows Server e até com o servidor Hyper-V gratuito.
Existem formas de hardware para resolver o problema também. Espero que isto ajude.