Você tem várias partições e, em caso afirmativo, o backup falha nessas outras partições que não são do sistema?
O SBS 2008 foi instalado da fábrica? Em outras palavras, é uma instalação OEM? É possível que a partição do sistema não esteja marcada como ativa. Dê uma olhada nesta postagem do TechNet e veja se você está disposto a tentar a correção sugerida: link
Aviso: Você estará usando o Diskpart como administrador. Você pode limpar completamente seu sistema se não entender o que está fazendo. Leia cuidadosamente. Atue com cuidado. Viva por muito tempo e ... bem ... você sabe. =)