Certifique-se de que quando você 'toca' no arquivo que o lighttpd ainda tem permissões para acessar o arquivo.
Em segundo lugar, verifique se o mod scgi está habilitado no lighttpd conf
Por fim, se estiver vinculando a uma porta com menos de 1024 (provavelmente é), precisa de privilégios de root ou superusuário para vincular. sudo deve ser capaz de ligar o socket a uma porta inferior.
EDIT: fez uma rápida pesquisa no google sobre o erro e descobriu o seguinte: link