O NFS é, ou pode ser, uma SAN - então você tem um problema com as definições.
Certamente, uma solução de armazenamento NFS de 1 Gbps usada em uma rede compartilhada com outro tráfego provavelmente será mais lenta que uma rede dedicada FCoE de 10/40/100 Gbps, mas, novamente, você pode executar o NFS nessas velocidades e em uma rede dedicada. Então tudo se resume ao que você realmente tem versus o que você poderia ter dado orçamento, etc.
Agora você diz que tem 'alta carga de CPU' - é que, na verdade, a alta carga de CPU ou o processo alto aguardam enquanto o armazenamento é ativado? Se você tem uma carga de CPU realmente alta, o armazenamento mais rápido pode ajudar, mas está longe de ser garantido.
Basicamente você vai ter que voltar para nós com muito mais detalhes do que você tem agora para obter uma resposta concreta, qualquer outra coisa seria pura especulação.