O que você deve considerar é o que o gargalo realmente é. Nesse caso, eu diria que sua placa de rede (apenas 100MBit) atingirá seu limite antes que seu processador ou seus discos o façam.
Considere que uma rede de 100 Mbit só transfere realisticamente a 12MB / s, isso é tudo o que você precisa acompanhar. Geralmente, a menos que você esteja fazendo algumas coisas como compressão, deduplicação ou calculando a paridade RAID5, o processador gastará a maior parte do tempo esperando pelo (s) disco (s).
Para um NAS neste dia eu recomendo pelo menos 1Gbit (60MB / s, mas você pode empurrá-lo para 80+ se você usar coisas divertidas como jumbo frames e IPv6, provavelmente não vale a pena para um servidor doméstico) . Isso realmente depende do tamanho dos discos que você está fazendo backup e de quanto tempo você espera que isso aconteça.
Infelizmente, isso empurra o gargalo de volta para a placa-mãe. Eu não consegui encontrar nada definido sobre o que é a velocidade do seu controlador de disco, tudo o que vi apontou para o Ultra-ATA EIDE, que se limita a 16MB / s, tornando-o inútil para ir para lan gigabit. Claro que se você está bem com 100mbit, desconsidere o próximo parágrafo:)
Neste ponto, seria mais rápido rodar todos os seus discos via USB (teoricamente o máximo é 60MB / s, mas nunca vi mais de 40 - YMMV) do que usar a interface PATA integrada. Se você quiser a velocidade máxima de seus discos, escolha uma placa de extensão PCI (possivelmente com uma invasão de hardware barata, se a invasão do software do ubuntu sobrecarregar demais o processador) e conecte seus discos internos a isso.
Parece ao contrário, mas a CPU é provavelmente a parte mais rápida da plataforma.