Existem várias maneiras de fazer isso. IMO é mais fácil montar sua partição TrueCrypt para / usr / local e "instalar" o vbox e as bibliotecas lá.
Você pode copiar manualmente o vbox para / usr / local (/ usr / local / bin, / usr / local / lib, etc) ou compilar o vbox a partir da fonte usando a opção PREFIX = / usr / local, e então instalar.
Você então precisa ter certeza de que / usr / local / bin / usr / local / lib está em seu caminho.
Modifique essas direções se você escolher um ponto de montagem alternativo.
Provavelmente, é mais fácil manter o vbox instalado no local padrão e, ao criar um convidado, colocar o disco rígido virtual convidado em sua partição criptografada.