Para o mysql você pode usar o mysqldump para despejar o conteúdo do banco de dados em um arquivo. Além disso, você normalmente só precisa fazer backup dos arquivos de configuração ( /etc
e quaisquer outros diretórios modificados), de quaisquer outros diretórios de dados, arquivos de log e da lista de pacotes instalados. Você deve poder restaurar o sistema fazendo uma nova instalação do SO, instalando os pacotes da lista e substituindo os arquivos de dados e configuração.