Você tem um CPU alto (tempo ocioso 3,1%, tempo bom 0%) e provavelmente uma alta carga de disco (tente ver a saída do vmstat, verifique se há algum número fora de escala no bloco de entrada / bloqueio filas de saída ou algum valor alto no tempo de espera, o que significa que, se não estiver errado, o tempo gasto aguardando a conclusão de alguma E / S).
Em um sistema não carregado, você terá o tempo de espera próximo a 0% e valores pequenos para os blocos lidos / gravados.
Eu experimentei problemas semelhantes com um site, onde o mysql estava usando muito disco e memória, enquanto o php / apache estava principalmente ligado à CPU ... A solução era dividi-lo em dois: o front-end www em um máquina, o mysql back-end em outro. As coisas ficaram mais suaves então ...
De qualquer forma, tente entender melhor o que está causando sua carga - talvez seu sendmail seja parte do problema, vejo muitos desses processos no estado "D" (esperando pelo dispositivo - isto é, ligado ao disco). Antes de mais nada, assegure-se de que está trabalhando para você e não para os outros (retransmitindo os e-mails dos spammers ou algo assim ...)
Tenha uma boa caçada! :)