você terá que abrir [path to your theme]/gtk-3.0/apps/unity.css e substituir
-UnityDecoration-extents: 28px 0 0 0; para -UnityDecoration-extents: 28px 1px 1px 1px; .
e adicione:
border: 1px solid <your border color>;
para UnityDecoration.left, UnityDecoration.right {