IMHO, depende do que você quer.
Se você estiver usando os dois protocolos (v4 e v6) para oferecer o mesmo serviço (por exemplo, IMAP / S ou HTTP, ou qualquer outro), e quiser que os clientes sejam transparentes para o protocolo - ou seja, se você deseja que os clientes habilitados para v6 usem v6 e outros usem v4, e ninguém se preocupe com o que estão usando - e use o mesmo nome de host em cada registro.
Se você quiser que as pessoas possam selecionar o protocolo pelo nome do host, use nomes de host diferentes para os registros A e AAAA.
Portanto, para o meu servidor da Web, onde quero que os clientes sejam independentes de protocolo, eu uso o mesmo nome de host:
www.teaparty.net. 3600 IN A 178.18.123.145
www.teaparty.net. 3600 IN AAAA 2a01:8000:0:4::1:1
Para o meu servidor pool ntp, onde decidi que gostaria que as pessoas pudessem selecionar o protocolo, usei diferentes:
ntp.teaparty.net. 3600 IN A 178.18.123.148
ntp6.teaparty.net. 3600 IN AAAA 2a01:8000:0:4::123:123
Desenvolva o comportamento do cliente que você deseja incentivar e faça as políticas de acordo.