Você não parece realmente saber o que está fazendo. Primeiro você deve obter um despejo de dados para proteger contra qualquer tipo de corrupção.
Então você está usando uma replicação Master-Master, certo?
Isso soa estranho, já que você só fornece um status SLAVE e um status MASTER, mas precisamos das saídas de status MASTER e SLAVE. Além disso, não há instruções replicate_ignore_ *, isso não se parece com uma replicação Master-Master. Além disso, não há instruções de erro no SLAVE STATUS. Eles teriam mostrado quaisquer erros de replicação.
Como corrigir isso: Obtenha um dump limpo de cada mestre e insira-o no outro mestre. É descrito no manual do mysql, aqui está a versão curta:
mysql> FLUSH TABLES WITH READ LOCK;
$> mysqldump -uroot -p<pass> --opt --all-databases | gzip --fast > dump_master1.sql.gz
mysql> UNLOCK TABLES;
Lembre-se: não basta executar um comando que alguém lhe contou! Procure no manual primeiro e verifique o que ele faz. Configurar seu SKIP_SLAVE_COUNTER para algo como 9999 é a razão pela qual sua nova tabela não está aparecendo em seu escravo, porque ela ignora 9999 declarações SQL, o que provavelmente ainda não aconteceu! Normalmente você não ajusta SKIP_SLAVE_COUNTER para mais 1, depois executa START SLAVE e vê com SHOW SLAVE STATUS se houver algum novo erro.