No Pavucontrol, na guia " dispositivo de entrada ", você pode ter 2 dispositivos: escolha "construído em analógico" e verifique se "microfone interno" está selecionado.
Normalmente, a comutação entre o microfone interno / externo é automática. Se estiver quebrado, você pode tentar conectar um microfone externo (ou um fone de ouvido, apenas para o teste) no conector do microfone e ver se o dispositivo de entrada "pavucontrol" muda.
Você também pode tentar testar outros perfis na guia "configuração" do pavucontrol.
Se continuar ruim, você pode tentar redefinir a configuração do Pulseaudio copiando e executando este comando em um terminal:
rm -r ~/.config/pulse; pulseaudio -k