Os números que você publicou parecem ótimos. Mas é difícil dizer o que mais está acontecendo. Se o servidor está indo bem - o que significa que os tempos de resposta estão em um intervalo aceitável, sem picos, tudo está funcionando como esperado - então siga a regra de ouro "se estiver funcionando, não mexa com isso".
Mas se você quiser fazer alguns estudos, há um grande template do engenheiro de desempenho Brendan Gregg que descreve provavelmente a maioria dos possíveis gargalos em um servidor Linux e comandos para monitorá-los / revelá-los.
Eu recomendo passar pelos slides dessa página também.
É importante também ter monitoramento contínuo (usando algo como munin ), já que é a única maneira de encontrar problemas ocorrendo em momentos estranhos, ou muito esparsamente e permite que você detecte tendências (futuros problemas) também.
Edit: oh, e não esqueça de logs (como eu acabei de fazer), sempre verifique os logs.