Isso faz perfeitamente sentido para determinado hardware: CPU rápida, disco lento (HDD não SSD), apenas um disco.
Os dados devem ser lidos e escritos. A quantidade de dados gravados é a mesma em ambos os casos, mas a leitura de um arquivo compactado significa que menos dados precisam ser lidos. Além disso, geralmente é muito mais rápido ler um único arquivo grande do que ler um diretório. Este efeito é maior se houver muitos arquivos pequenos. Você pode reduzi-lo lendo a estrutura de diretório no cache para que o disco não precise saltar entre os inodes e os blocos de dados:
# Edit: This works under Unix only
find /dir/to/be/copied -printf "" # just read the names
find /dir/to/be/copied -perm 777 -printf "" # just read the inodes
Se a CPU não diminuir a entrada de dados (porque a deflação demora mais tempo do que a leitura), a extração é mais rápida que a cópia.
Se você copiar de um SSD para outro dispositivo e sua CPU for da idade da pedra, a cópia será mais rápida.