Não, não tem nada a ver com Wubi. O Wubi instala o Ubuntu como um software no windows 7. Se a sua reposição de fábrica estiver concluída e ainda estiver a dizer o seu BOOTMGR em falta, pode usar um disco de reparação do windows 7 ou o windows 7 live usb ou live cd
inicialize a partir de qualquer disco do Windows acima e vá para o reparo, mas não para usar o reparo de inicialização, em vez de reparar usando o prompt de comando do Windows
digite os dois comandos a seguir em cmd exatamente
Bootrec / fixmbr 'pressione enter'
Bootrec / fixboot 'pressione enter'
agora reinicie você pode ver o gerenciador de inicialização do Windows novamente.
ou
se você pode obter o disco de reparo do Windows ou o disco do sistema operacional ou o USB ao vivo, use a redefinição de fábrica novamente para resolver o problema