Eu consegui isso com o seguinte, que funciona bem.
Crie /etc/cron.d/reboot
com o conteúdo abaixo. Nota - Já faz um tempo, você deve verificar a sintaxe.
@reboot root run-parts /etc/cron.reboot
Crie uma pasta /etc/cron.reboot
De lá, é uma questão de colocar os arquivos na pasta cron.reboot.