De uma verificação rápida, parece impossível alterar Mas você pode tentar usar o iptables para redirecioná-lo através de outra porta, tente ver se esse link será útil
Depende de quais são suas necessidades
Um servidor Linux pode ser configurado para usar uma porta de origem alta (acima de 1023) para sincronização NTP com um servidor Stratum 1/2?
Existe alguma desvantagem em fazer isso?
De uma verificação rápida, parece impossível alterar Mas você pode tentar usar o iptables para redirecioná-lo através de outra porta, tente ver se esse link será útil
Depende de quais são suas necessidades
Can a linux server be configured to use a high source port(above 1023) for NTP synchronization
Eu dei uma rápida olhada nas páginas de manual do ntpd (8), ntp.conf (5), ntpdate (8) em um sistema CentOS 6 que eu tenho que entregar e nenhuma delas faz qualquer menção de poder mudar a porta que eles escutam ou conectam. Eu não esperaria que outras distribuições ou sistemas operacionais fossem diferentes.
Eu acho que a resposta à sua pergunta é, portanto, não.
Tags networking ntp linux port